Factores de transcripción en las plantas

Este es el tema de mi tesis de doctorado y en estos momentos estoy preparando la presentación final de mi trabajo de los últimos 4 años. Buscando formas novedosas de visualizar algunos datos me encontré con Many Eyes, espectacular.

Aquí les dejos algunoas de los gráficos que creé del número de factores de transcripción por especie y por familia de factores.

tesis: la frontera final

Estoy a punto de por fin entregar mi tesis de doctorado.

Luego de entregarla tengo que esperar approx. 2 meses por las evaluaciones de 4 expertos en mi área de trabajo. Si las evaluaciones recomiendan continuar con el proceso tendré que hacer una presentación pública de mi trabajo. Así que este apenas es el principio del final!

Mientras tanto aquí les dejo un representación gráfica de lo que hice en los últimos años.


La nube de palabras (word cloud) fue creada con Wordle

Factores de transcripción bZIPs en plantas - Nube de etiquetas

Tenemos que un artículo sobre la familia de factores de transcripción bZIP, que acabamos de enviar a PLoS ONE, en segunda vuelta. (actualización: artículo publicado el 12.08.08)

Aquí está la nube de etiquetas para que se haganuna idea de que trata el artículo.

Factores de transcripción en Chlamydomonas

Siguiendo el ejemplo de Clastic Detritus y Green Gabbro, aquí va la nube de etiquetas (creada con TagCrowd) de uno de mis artículos recientes, que fue publicado en Genetics (Vol 179 No. 1, pp 31-39). Chlamydomonas es un alga verde, y el artículo trata de las familias de factores de transcripción es esta alga y otras plantas.

Propaganda PlnTFDB

Después de 4 meses de estar incapacitado, por un problema con mi pierna derecha, vuelvo a la universidad. Claro, esos 4 meses no fueron perdida completa. Salió un artículo presentando la base de datos de factores de transcripción en plantas (PlnTFDB: Plant Transcription Factor Database) que hemos creado.

Decidimos publicar el artíclo en BMC Bioinformatics, una revista de acceso abierto (Open Access, OA). Sobre el modelo de OA, solo ventajas. Primero, el artículo está disponible en internet para todo aquel que este interesado en leerlo, es posible redistribuirlo libremente, y crear trabajos derivados siempre y cuando la fuente original se referencie apropiadamente. En segundo lugar, el tiempo total desde que se envió el artículo por primera vez a la revista hasta que fue publicado en línea, fue de 47 días. Los comentarios y sugerencias de los evaluadores anónimos fueron en verdad de ayuda para mejorar la calidad del artículo y presentar un mensaje mas claro, y en algunos casos mejorar la base de datos en línea.

Lo que viene ahora es extender la base de datos, principalmente agregar datos experimentales sobre los factores de transcripción que hemos predicho.