Darwin day

Hoy hace 200 años nació Charles Robert Darwin , y en noviembre hace 150 años publicó su libro: Sobre el origen de la especies por medio de la selección natural. Para muchos Darwin es el Newton de la biología y como bien lo dijo Theodosius Dobzhansky, nada en biología tiene sentido si no se mira a través de la luz de la evolución.

Aquí les dejo uno de los primeros árboles filogenéticos, este apareció en uno de los cuadernos de notas de Darwin.



Feliz día!

Defensa de tesis

Finalmente, después de casi 4 años terminé el doctorado. El 28 de noviembre a las 10a.m. defendí mi tesis de doctorado en público.

El título de la tesis es: Identification of transcription factor genes in plants.

El trabajo escrito fue evaluado por Prof. Dr. Bernd Mueller-Roeber, PD. Dr. Stefan Rensing y Prof. Dr. Erich Grotewold. Los miembros del comité doctoral que evaluaron la defensa pública fueron: Prof. Dr. Bernd Mueller-Roeber, Prof. Dr. Martin Steup, Prof. Dr. Carsten Beta, PD. Dr. Ingo Dreyer, PD. Dr. Stefan Rensing y Dr. Dirk Hincha.

La presentación en PDF se encuentra en http://plntfdb.bio.uni-potsdam.de/thesis.

El documento de tesis está pronto estará disponible en el servidor de publicaciones de la Universidad de Potsdam.

Factores de transcripción en las plantas

Este es el tema de mi tesis de doctorado y en estos momentos estoy preparando la presentación final de mi trabajo de los últimos 4 años. Buscando formas novedosas de visualizar algunos datos me encontré con Many Eyes, espectacular.

Aquí les dejos algunoas de los gráficos que creé del número de factores de transcripción por especie y por familia de factores.

GCB 2008 - charlas sobresalientes

La semana que pasó estuve en Dresden asistiendo a la conferencia alemana de bioinformática. En general el nivel de las charlas fue muy bueno. Dos de las "keynotes" me parecieron excelentes, la de Trey Ideker y la de Michael Ashburner. La primera trató sobre biología de sistemas, y la segunda sobre el uso, pasado, presente y futuro de las ontologías en biología.

Les dejo una pequeña presentación en PDF con los principales puntos de las charlas.

GCB 2008 en Dresden

Esta semana se lleva acabo la conferencia alemana de bioinformática (GCB2008) en la hermosa ciudad de Dresden, los organizadores han escogido el museo alemán de la higiene como sede del evento.

Aquí les dejo una mujestra de una de las maravillas que se encuentran en las cercanías del museo.



Mas adelante habrá una entrada con un resumen de las presentaciones que mas me impactaron/interesaron. Hasta la próxima.

Evolución de las plantas I

Las plantas son organismos eucarióticos fotosintéticos, lo que quiere decir que 'fabrican' los materiales que necesitan para vivir a partir de agua, dióxido de carbono y luz solar.

Las plantas aparecen en la tierra aproximadamente hace 1.400 millones de años, cuando una célula eucariótica que se alimentaba de cianobacterias (bacterias con la capacidad de hacer fotosíntesis), no digirió a la bacteria sino que la mantuvo intacta en su citoplasma. Con el tiempo y las generaciones esta bacteria se convirtió en un simbionte, que fue reduciendo de tamaño y pasó a depender completamente del organismo hospedero, convirtiéndose de hecho en un organelo de este, el cloroplasto, que es el organelo en donde tiene lugar la fotosíntesis. Este proceso se conoce como endosimbiosis, y ha ocurrido varias veces a lo largo de la evolución.

La siguente figura resume las relaciones evolutivas de los principales grupos de plantas existentes hoy en día. De la endosimbiosis original hace mas de 1.400 millones de años se derivaron tres grupos principales, las glaucofitas, las algas rojas (rhodophyta) y las plantas verdes (Chloroplastida). La inmensa mayoría de las plantas que conocemos y que están en nuestras casas son de este último tipo.


Ya vendrá mas información relacionada con la evolución de estos maravillosos organismos.

tesis: la frontera final

Estoy a punto de por fin entregar mi tesis de doctorado.

Luego de entregarla tengo que esperar approx. 2 meses por las evaluaciones de 4 expertos en mi área de trabajo. Si las evaluaciones recomiendan continuar con el proceso tendré que hacer una presentación pública de mi trabajo. Así que este apenas es el principio del final!

Mientras tanto aquí les dejo un representación gráfica de lo que hice en los últimos años.


La nube de palabras (word cloud) fue creada con Wordle